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Richard Dern
2025-04-25 16:13:23 +02:00
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@@ -13,7 +13,7 @@ Rien de trop ambitieux, juste de quoi conjuguer étymologie, taxonomie, cladisti
Une manière d’apprendre, de structurer, et de jouer avec un sujet fascinant : **la manière dont on nomme les créatures fossiles**. Une manière d’apprendre, de structurer, et de jouer avec un sujet fascinant : **la manière dont on nomme les créatures fossiles**.
Très vite, j’ai réalisé que le simple fait de vouloir **uniformiser les noms de genres valides** dans une base de données propre nécessitait une rigueur que peu de ressources offrent. Très vite, j’ai réalisé que le simple fait de vouloir **uniformiser les noms de genres valides** dans une base de données propre nécessitait une rigueur que peu de ressources offrent.
La [Paleobiology Database](https://paleobiodb.org/), malgré son intérêt, m’a parfois renvoyé des résultats incohérents, ambigus ou lacunaires. La [Paleobiology Database](https://paleobiodb.org/) (PBDB), malgré son intérêt, m’a parfois renvoyé des résultats incohérents, ambigus ou lacunaires.
J’ai écrit de nombreux scripts Python pour croiser, trier, filtrer, nettoyer ces données (avec plus ou moins de succès), et ces scripts ont fini par s'accumuler sans que je puisse me souvenir de l'ordre dans lequel les lancer — ce qui est indispensable, afin de garantir la reproductibilité de ma méthode. J’ai écrit de nombreux scripts Python pour croiser, trier, filtrer, nettoyer ces données (avec plus ou moins de succès), et ces scripts ont fini par s'accumuler sans que je puisse me souvenir de l'ordre dans lequel les lancer — ce qui est indispensable, afin de garantir la reproductibilité de ma méthode.
Puis, en constatant que de nombreux articles scientifiques dans différents domaines faisaient appel à [R](https://www.r-project.org), j’ai tenté de l’adopter pour mes propres besoins. Puis, en constatant que de nombreux articles scientifiques dans différents domaines faisaient appel à [R](https://www.r-project.org), j’ai tenté de l’adopter pour mes propres besoins.